Genaugenommen werden als Humus die abgestorbenen organischen Bestandteile des Oberbodens ( die oberen 20 bis 30cm des Erdbodens) bezeichnet.Diese bestehen aus abgestorbenen Pflanzen und Lebewesen, die von den Bodenlebewesen in den Boden eingetragen und zersetzt werden. Umgangssprachlich meint man damit aber einfach nur gute, nährstoffreiche Gartenerde und das trifft auch sehr gut seine Funktion. Der Humusgehalt eines Bodens läßt sich durch einarbeiten von Kompost oder Gründüngung verbessern.

Von Alters her gehört das Umgraben des Bodens im Herbst zu den wichtigsten Tätigkeiten, wenn man an Gartenarbeit denkt. Gerade in den letzten Jahren findet dahingehend jedoch ein deutliches Umdenken statt, dass sich sogar bis in den Erwerbsgemüse- und -ackerbau durchsetzt.
Sinn des Umgrabens ist die Durchlüftung des Bodens und die Vernichtung angewehter Unkrautsaaten und möglicher Schädlingseier. Dem gegenüber steht die Vernichtung der langsam entstandenen und belebten Bodenschichtung durch tiefes ungraben. Dabei werden luftabhängige Schichten in sauerstoffarme Tiefen transportiert und andersherum und die ganze mühselige Arbeit der Bodenlebewesen wird zunichte gemacht, was die Fruchtbarkeit des Bodens mindern kann.
Im Biogartenbau wird aus diesem Grunde gänzlich auf das Umgraben verzichtet. Stattdessen lockert man den Boden vorsichtig auf mit Hilfe einer Grabgabel oder eines Sauzahns ohne dabei die Bodenschichtung durcheinander zu bringen. Dieses belüftet und lockert den Boden als Vorbereitung für die nächste Vegetationsperiode.

Der Fruchtwechsel ist eine Verfeinerung der Fruchtfolge, denn er bedeutet die aufeinander abgestimmte Abfolge von Gemüsearten auf einet bestimmten Fläche, bei der sich stets Arten aus verschiedenen Familien miteinander abwechseln. Kreuzblütler folgen auf Schmetterlingsblütler usw.

Auf diese Art und Weise verhindert man die Ausbreitung bestimmter Schädlinge oder Krankheiten, die bestimmte Pflanzenfamilien betreffen.Eine gefürchtete Krankheit der Kohlarten, die Kohlhernie, befällt nämlich auch alle anderen Gewächse der Familie der Kreuzblütler wie den Rettich, Radieschen und Senf. Da solche Schaderreger oft im Winter im Boden überwintern können, würde man ihnen einen sehr guten Nährboden bereiten, wenn man nach dem Kohl im letzten Jahr nun Radieschen auf dieselbe Stelle im Beet säen würde und der Schädling breitet sich noch mehr aus.

Gründüngung ist eine natürliche Methode im Acker- und Gartenbau zur Bodenverbesserung.

Man bezeichnet damit das Einarbeiten von grünen Pflanzen oder angewelktem Pflanzenmaterial (Ernterückstände, Stroh) in den Boden. Meist werden die Pflanzen sogar extra für diesen Zweck ausgesät, beispielsweise im Zwischenfruchtbau. In dem Fall werden zum Beispiel Raps, Sonnenblumen, Klee (besonders Luzerne), Weißer Senf oder Phacelia gesät.

Gründüngung unterstützt die Bildung von Humus und wirkt gegen Bodenerosion und das Auswaschen von Pflanzennährstoffen.

Bei der Verwendung von schnellwachsenden Gründüngern werden unerwünschte Unkräuter unterdrückt.

Andere Pflanzen wie Sonnenblumen wurzeln tief und lockern den Boden tiefgründig auf.
Nutzt man Hülsenfrüchtler (Legominosen) wie Erbsen, Ackerbohnen oder Lupinen als Zwischenfruchtpflanzen,so wird der Boden zudem mit Stickstoff angereichert.

Insbesondere bei Rübenanbau werden Senf und Ölrettich zur Nematodenbekämpfung eingesetzt.